Siden etableringen i 2013 har Johanniterhjælpen samarbejdet med en række organisationer og virksomheder m.v., enten ved at donere til disse, eller ved at få støtte fra dem, eller gennem fælles arbejde.

Disse omfatter bl.a.:

• Skt. Petri Kirkes menighedsråd
• Morgencaféen for Hjemløse (“Giv Din Hånd”)
• The Mermaid Ball
• Skt. Petri Skole
• Vor Frue Kirkes hjemløseprojekt “Hugs & Food”
• Johanniter Hilfswerk Omaruru (Namibia)
• Johanniter Baby Therapy Center (Sydafrika)